Il s'agit d'une formation à l'analyse de données NGS (Next Generation Sequencing) de type RNA-seq, principalement à destination des chercheurs travaillant dans le domaine du cancer ayant des recherches impliquant l'analyse de données de séquençage haut débit de type RNAseq (transcriptomique) en population. L'analyse de données de type single cell (en cellule unique) ne sera pas abordé dans ce cours.
La formation a pour objectif de vous permettre d'acquérir les notions théoriques vous permettant une meilleur compréhension de ce que permettent de telles analyses, pour mieux préparer les design expérimentaux de vos recherches. Elle a également pour but de vous initier à la pratique de ce type d'analyse, pour vous permettre de mieux évaluer ce que ce type d'analyse permet et ne permet pas. Pour les personnes disposant de données à analyser, il sera possible d'appliquer les pipeline présentés dans le cours sur vos données, toutefois pour aller plus loin dans l'analyse nous vous invitons à vous rapprocher des bio-informaticiens de vos institutions qui pourront vous aider à appréhender vos résultats.
