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本课程讲授在系统水平上研究微生物基因功能及调控网络的方法，让学生掌握微生物功能基因组学的前沿进展及发展方向，并能应用微生物功能基因组学的方法解决实际生物学问题。
Overview
Syllabus
- 第一章 微生物功能基因组学导论
- 1.1. 功能基因组学的诞生
- 1.2. 功能基因组学的任务和挑战
- 1.3. 微生物基因组研究导论
- 1.4. 微生物基因组研究导论（下）
- 第二章 DNA测序技术
- 2.1. 第一代测序技术
- 2.2. 454测序平台
- 2.3. Illumina测序平台
- 2.4. 三代DNA测序技术
- 2.5. 关键的测序技术
- 2.6. 微生物基因组的组装与注释
- 第三章 微生物转录组学
- 3.1.转录及转录组学概述
- 3.2. 转录组学的研究技术
- 3.3. 细菌转录组学的研究与应用（一）
- 3.4. 细菌转录组学的研究与应用（二）
- 3.5. 转录组学研究拓展
- 第四章 微生物蛋白质组学
- 4.1. 蛋白质组学简介
- 4.2. 蛋白质组学研究流程
- 4.3. 蛋白质组的分离与定量技术
- 4.4. 蛋白质组学的鉴定技术（一）
- 4.5. 蛋白质组学的鉴定技术（二）
- 4.6. 蛋白质组学的应用
- 第五章 微生物代谢组学
- 5.1. 代谢组及代谢组学概况
- 5.2. 代谢组基本流程
- 5.3. 代谢组学的研究技术和方法（一）
- 5.4. 代谢组学的研究技术和方法（二）
- 5.5. 代谢组学数据处理与分析
- 5.6.代谢组学的应用
- 第六章 基因组学实例-分枝杆菌
- 6.1.分枝杆菌概况
- 6.2. 分枝杆菌基因组学研究
- 6.3. 分枝杆菌蛋白质组学研究
- 6.4. 生物信息学研究
- 6.5. 分枝杆菌噬菌体逃逸宿主防御的分子机制研究
- 第七章 微生物翻译组学
- 7.1. Introduction
- 7.2. Ribosome profiling
- 7.3 GTI-seq and QTI-seq
- 7.4. disome-seq
- 7.5. Selective Ribosome profiling
- 7.6. Ribosome profiling in bacteria and perspective
- 第八章 基因组学实例-蓝细菌
- 8.1. 基因组特性
- 8.2. 基因功能注释原理及应用
- 8.3. 蓝细菌基因注释详解（上）
- 8.4. 蓝细菌基因注释详解（下）
- 8.5. 蛋白互作网络分析
- 8.6. 蓝细菌功能基因研究实例
- 期末考试
Taught by
Wenli Chen, ZHANG HUA, ZHENG JIN SHUI, ZHOU ZHIPENG, and Feng Huang
